Легендарная R-серия спортивных мотоциклов Yamaha, к которой принадлежит модель YZF-R3, выпускается уже два десятилетия. За эти годы флагманские представители линейки R1 и R6 великолепно себя зарекомендовали, выиграв множество престижных мировых чемпионатов. Тем не менее, японский производитель справедливо посчитал, что этого недостаточно, чтобы завоевать весь рыночный сегмент гоночных мотоциклов.
Модель была представлена сравнительно недавно – в 2015 году. Причиной ее создания было не только удовлетворение пожеланий новичков, но и стремление компании Yamaha Motor ответить на вызов со стороны двух других знаменитых японских производителей. Они уже успели выпустить к тому времени свои малокубатурные байки, поэтому ответ бренда был строго выверен.